На всех дочерних организациях АО «ЦАЭК» внедрена и функционирует система экологического менеджмента в соответствии с международным стандартом ISO 14001. Дочерние организации повсеместно внедряют методы работы, отвечающие требованиям данного стандарта. Сертификация подтверждена органом по сертификации ТОО «TÜV Rheinland Kazakhstan».