В группе компаний АО «ЦАЭК» проводятся взаимные аудиты по экологии, направленные на выявление наилучших практик по управлению охраной окружающей среды на производстве, по обращению с отходами производства и потребления, повышению информированности в области охраны окружающей среды.

В 2018 году на объектах генерации АО «ЦАЭК» (Петропавловской ТЭЦ-2, Павлодарских ТЭЦ-3 и ТЭЦ-2, Экибастузской ТЭЦ) был проведен инициативный независимый экологический аудит, включающий в себя оценку наилучшим доступным технологиям (BAT Assessment). Группой международных и местных экспертов-аудиторов был проведен аудит и оценка наилучшим доступным технологиям и составлен отчет с рекомендациями по сокращению выбросов загрязняющих веществ и повышению экологической эффективности действующих станций в соответствии с национальными и международными стандартами.

В 2021 году Корпорация разработала проект предварительного технико-экономического обоснования по внедрению наилучших доступных технологий для 2-х своих крупных станций. В данном проекте рассмотрены возможные к внедрению наилучшие доступные технологии по сокращению эмиссий в атмосферный воздух и оценены наиболее оптимальные варианты.